本实用新型公开了一种遥控器及应用该遥控器的智能马桶控制系统，包括壳体，壳体内设有控制单元、感应模块、第一通讯模块和电源模块，壳体设有触发模块，感应模块、第一通讯模块和触发模块分别与控制单元电连接，电源模块为各模块供电，触发模块用于接收用户的输入指令产生相应的带有位置信息的触发信号并传输至所述控制单元，感应模块用于感应遥控器的位置状态，并生成相应的位置信号传输给控制单元，当控制单元接收到的触发信号的位置信息和所述位置信号相匹配时，其生成相应的控制信号传输至所述第一通讯模块。本实用新型能够使遥控器在指定位置状态下进行有效命令的控制，防止误操作。