本实用新型涉及一种含盐有机废水的净化系统，包括依次连通的化学软化除硬装置、离子交换装置、膜分离浓缩装置、有机物分离装置、芬顿氧化装置和生化氧化装置，所述生化氧化装置的出料口与所述化学软化除硬装置的入料口连通；所述离子交换装置具有出料口、酸废液出口和碱废液出口，所述离子交换装置的出料口与所述膜分离浓缩装置的入料口连通，所述酸废液出口与所述芬顿氧化装置的入料口连通，所述碱废液出口与所述生化氧化装置的入料口连通。该净化系统在有机物去除过程中，最大程度地利用了离子交换的再生酸、碱废液、预氧化产出的污泥和蒸发结晶产出的氯化钠结晶盐等，不仅节约了投资，还避免了资源浪费和环境的二次污染。