本实用新型公开一种防水层的拼接缝结构及防水层的施工方法，该结构包括：相邻铺设于基层表面的第一防水卷材和第二防水卷材，第一防水卷材和第二防水卷材的拼接处留有拼接缝；密封部，密封部填于拼接缝内；盖口条，盖口条沿拼接缝的方向铺设于密封部的表面，盖口条两侧的上表面和/或下表面分别与拼接缝两侧的第一防水卷材和第二防水卷材的上表面和/或下表面相搭接，通过在相邻铺设于基层表面的第一防水卷材和第二防水卷材之间的拼接缝内用密封部填充，拼接缝处采用盖口条铺设于密封部表面，解决了防水卷材搭接缝之间渗漏的风险隐患，并有效保护了密封部的防水质量，使相邻的防水卷材之间形成整体的防水层，提高防水层的防水性能和施工效率。