本实用新型公开了一种具有冲洗功能的海水淡化系统，包括预处理装置、高压泵、反渗透淡化装置、中转集水装置和冲洗装置，预处理装置、高压泵、反渗透淡化装置、中转集水装置依次通过管道连接，预处理装置包括复数个串联设置的过滤器，过滤器中设置有滤芯，反渗透淡化装置中设置有反渗透膜，冲洗装置包括药剂投放装置、冲洗箱和冲洗泵，药剂投放装置与冲洗箱连接，冲洗箱与中转集水装置通过第一管道连接，冲洗箱与冲洗泵通过第二管道连接，冲洗泵与过滤器通过管道连接，冲洗泵与反渗透淡化装置连接。本实用新型提出的具有冲洗功能的海水淡化系统，可避免反渗透膜表面结垢和滤芯堵塞影响海水淡化系统正常工作。