本实用新型提供一种生物实验用盖玻片清洗器，涉及生物领域，该生物实验用盖玻片清洗器，包括箱体，箱体内设有机架，机架内设有两个清洗毛刷带，机架内滑动配合有夹持棒，夹持棒位于两个清洗毛刷带之间，箱体内壁顶部设有喷头，喷头出水端朝向清洗毛刷带，机架的一端延伸至箱体外，机架的另一端连接有导轨。所述夹持棒包括滑棒、滑杆、多个夹持块和多个弹簧。该生物实验用盖玻片清洗器，利用盖玻片插入夹持块内，使得盖玻片的两面都能够与毛刷接触，通过夹持棒在两个清洗毛刷带之间移动，达到清洗的效果。代替将盖玻片放在放置槽内用水冲刷的方式，避免盖玻片朝向槽内的一面不容易被清洗到而残留污物，提高了清洗效果。