一种防堵塞的船用海淡水热交换器，包括热交换器本体，热交换器本体左右两端通过法兰分别连接有左端盖和右端盖，右端盖左右侧两侧分别开设有海水出口二和海水进口；所述右端盖内设置有从动辊和主动辊，从动辊与主动辊之间通过过滤网连接；所述主动辊通过主动滚轴转动连接于右端盖内；所述主动辊轴一端伸出右端盖；所述右端盖上方安装有电机，所述电机的输出轴端通过皮带与主动辊轴的伸出端连接，电机下方的右端盖内设置有液位计；所述液位计通过网箱连接于右端盖内。与现有技术相比，本实用新型的一种防堵塞的船用海淡水热交换器，通过设置带过滤网的辊子线，过滤网将沉淀在过滤网上的泥沙杂物输送至废料收集区域，有效避免海水进口端发生堵塞。