本实用新型公开了一种高效杀菌消毒的医院污水处理设备，包括灭菌罐和滤壳，所述灭菌罐包括外壳体和内壳体，内壳体设置在外壳体的内部，内壳体的下端中部设置有第一进水管，外壳体的底部右方设置有第一出水管；所述灭菌罐的上方设置有上盖，上盖上安装有旋转杆，旋转杆的下端伸入内壳体中；所述灭菌罐的下方设置有滤壳，滤壳的上端中部设置有第二出水管，第二出水管的上端与第一进水管连接；所述滤壳的下方安装有沉淀槽。本实用新型污水处理效率高，杀菌效果好，通过设置旋转杆和搅拌杆能够使二氧化氯与污水充分快速混合，提高污水处理速度和杀菌效果，通过设置内壳体和外壳体，能够对污水进行分级杀菌处理。