本实用新型公开了一种病死牲畜无害化处理系统，包括：高速粉碎机，其上部具有进料口，其出料口设于下部；挤出机，其进料口与高速粉碎机的出料口连接，其还具有一废气出口并连接有废气处理装置，所述的挤出机为双螺杆挤出机或单螺杆挤出机；发酵装置，其进料口与挤出机的出料口连接，该方案将产生的废气导出至废弃处理装置中进行净化处理，避免了空气污染问题和加工场地的臭气问题，提高了处理的卫生安全性，而被加工出的牲畜熟肉沫可以转移至发酵床或高温干式厌氧发酵罐中进行发酵处理，使得最终得到的残渣可以作为有机肥原料被调制，而发酵产生的沼气可以导出作为气体燃料，实现了无害化处理各环节产物的经济利用价值。