本实用新型涉及一种用于河道治理的生态水电站，包括沿河道宽度方向设置将河道分割成上游段和下游段的坝体，上游段的两侧相对设置有护坝，疏水通道的入口端上方设有网型清障装置，两个护坝相互远离的一侧分别设有沉降槽和动力槽，网型清障装置与沉降槽的中部相连用于收集的小颗粒障碍物，动力槽内设有传动装置，网型清障装置的上方设有管型清障装置，挡沙坝的上侧设有浮力挡障装置，浮力挡障装置的倾斜角度随河道的水位变化而变化；尾水口的上侧设有与第二水轮，第二水轮的下端轮缘与尾水口排出的水接触并做功，第二水轮通过传动轴与传动装置传动连接。本申请通过的水电站充分利用水能对水体进行自净化，可以实现河道的生态治理。