本实用新型的清洁生长锥钻孔器的工具，包括底座和丝杠螺母机构，底座的前端设有夹持钻孔器手柄的圆弧形手柄卡槽，圆弧形手柄卡槽的中部断开形成左右对称的两个卡槽，底座的中部设有钻孔器锁止机构，钻孔器锁止机构包括支撑台和盖板，支撑台上设有半圆形凹槽，盖板为半圆形盖板，盖板的一侧铰接在支撑台上，钻孔器放置在半圆形凹槽内，盖板罩在钻孔器的外壁，盖板的另一侧与支撑台螺纹紧固连接，底座的后端设有丝杠螺母机构，螺母上设有与钻孔器同轴的螺纹孔，丝杠与螺母的螺纹孔连接，丝杠的后端设有转动手柄。本实用新型结构简单，占用空间小，安全高效，解决了生长锥堵钻的问题，可以节约采样成本，延长生长锥的使用寿命。