本实用新型提供了一种核酸等温扩增机构，包括基座以及设置于基座上的反应管架、光源、探测器、导向管筒；光源和探测器分别位于反应管架的两侧；反应管架上设有若干个容置槽，容置槽的侧壁设置有入射通孔和出射通孔，来自光源的光线能够依次穿过入射通孔、容置槽、出射通孔抵达探测器；入射通孔与光源之间设置一个导向管筒，使光线仅从导向管筒的轴向射入入射通孔。本实用新型的核酸等温扩增机构，利用导向管筒连接光源和反应管架，防止光源额外的光线进入容置槽造成光线干扰，同时多个容置槽同时引入光线，光照条件稳定均衡，检测结果可靠。在此基础上，本实用新型还提供了一种同步式核酸等温扩增仪。