本实用新型涉及生物实验器械领域，特别是涉及一种分离式单细胞悬液制备装置。本实用新型提供的分离式单细胞悬液制备装置包括底座、支撑装置和搅拌装置，所述支撑装置包括支架和悬架，所述支架和悬架上分别设有相互配合的导向件和限位滑动件，所述搅拌装置包括电机、受电机驱动的转轴，所述转轴包括驱动轴、连接轴和搅拌轴，所述连接轴的一端与驱动轴的远端螺纹连接，另一端包括横截面为多边形的容纳槽，连接轴与搅拌轴之间通过所述容纳槽套接，所述连接轴还包括位于容纳槽中的磁性件，所述搅拌轴的远端包括齿轮转子。本实用新型所提供的分离式单细胞悬液制备装置具有易操作、高效环保及可循环利用等优点。