本实用新型公开了一种在线色谱分析仪的预处理系统，包括预处理箱体，预处理箱体内设有至少两路样品流路，每路样品流路中设有针阀一；针阀一、样品过滤器一、针阀二依次相连；通过针阀二后进入样品除水除油过滤器一，进入样品气液分离罐；样品气液分离罐的出口分别经由压力表接入气动阀组；气动阀组与三通球阀三的一端相连，三通球阀另外两端分别与标气接口和样品流量计相连，样品流量计与在线色谱分析仪进样口连接。本实用新型适用于在线色谱分析仪分析多组分测量；预处理过程中仅使用物理方式进行过滤，未破坏样品的组成；两个或多个流路中均设有备用连接通道；色谱分析仪控制气动阀组进行流路切换。