本实用新型涉及一种双轴钻床的钻孔机构，所述钻孔机构固定设置于滑台上，滑台相对立柱可上下往复滑动；所述钻孔机构包括传动主轴、传动轴套、夹持部件和钻头；所述传动轴套滑动式套设于传动主轴上，传动轴套与钻孔动力机构的动力输出端传动连接，钻孔动力机构通过传动轴套驱动传动主轴转动，升降机构通过滑台驱动钻孔机构上下升降，传动轴套始终套设于传动主轴上并驱动其转动；所述夹持部件设置于传动主轴上，彼此通过锥形结构相互配合，钻头设置于夹持部件上，夹持部件锁紧于传动主轴的同时钻头锁紧。本钻孔机构设计简单、结构合理、性能可靠、精度高、稳定性好。