本实用新型公开了一种腔内切割吻合器及其钳头结构，包括钉仓套件、与钉仓套件相适配的钉砧、分别在钉仓套件和钉砧上对应设有的推刀槽，以及适于沿着推刀槽移动的切割刀；钉砧包括适于抵顶设于钉仓套件内的缝合钉的基体，以及在基体的长度方向的两侧对称设有的一对侧翼；在一对侧翼上对称地设有弧形铰接槽和弧形导向槽；以及钉仓套件包括钉仓架和安装在钉仓架上的钉仓，在钉仓架和钉仓上对应开设有推刀槽；钉仓架包括开设有推刀槽的基部，以及位于基部的长度方向的两侧设有的朝向钉砧一侧弯折成型的一对折翼部，在一对折翼部背离钉仓的外侧壁上设有适于与弧形铰接槽卡接的铰接柱，以及适于沿着弧形导向槽移动的导向柱。