本实用新型公开了一种无菌模块化储水箱及应用无菌模块化储水箱的制水系统，包括并列设置的两个子水箱，子水箱为长方体外形，且底面的较长边的长度大于侧面的高度，子水箱内设有浸没式紫外杀菌器。本实用新型的技术效果在于，储水箱置于一体化制水系统顶部，节省机房占地面积，亦可立式放置以利用竖直方向上的空间；可按需求增加水箱模块，模块之间自由切换，主水箱储水量不能满足要求时，备用水箱自动接入。储水箱采用弧形的抗压内壁设计，有效提高箱体强度。水箱内设喷淋球和浸没式紫外线灭菌器，保证水箱无二次污染。应用该无菌模块化储水箱的制水系统，能够实现一体化制水系统一机两水，纯水和超纯水分别储存，有助于满足不同场合下的需要。