本实用新型属于烟草种植领域，尤其涉及一种烟草育苗基质装填设备。所述设备包括基质盒、压接器以及封堵装置，所述基质盒包括顶、底均敞口且上下装配的上、下盒体，所述封堵装置包括下盒体下方设置的用于封堵下盒体底部敞口的纱布，纱布两端分别缠绕于主动辊和从动辊上，主动辊通过电机带动，下盒体底面两侧分别等高设有张紧辊，张紧辊平行主动辊设置且用于对纱布张紧并使得纱布贴靠下盒体底面；所述压接器包括基板以及基板底部固设的数个方框，搅拌杆底部呈圆锥状位于方框内、顶部位于外界并与搅拌驱动机构连接。本实用新型结构简单，能够有效实现每个苗穴内部的基质组分配比合理，提高烟苗成活率和活性。