本公开涉及一种河道旁用于净化河水的生物滞留系统，该系统包括设置于河道的河岸上的生物滞留池和水循环装置；生物滞留池包括防水池体和设置于池体内的填料模块，填料模块包括从上至下依次设置的储水层、过滤层、种植层、硝化作用净水层、砂隔离层、反硝化作用净水层和排水层；水循环装置包括排水管、水位限定管、抽水管和水泵。本公开的生物滞留系统可以加强河道中水体的流动，有利于促进河道中水体的净化和修复，具有良好的净化河道污水的效果。