本实用新型公开了一种双头泵结构，包括隔膜泵电机，在隔膜泵电机的两端部对称设置有泵头组件，泵头组件包括隔膜室，隔膜室设置有多个吸入腔，隔膜泵电机包括电机输出轴，电机输出轴包括在隔膜泵电机两个端部延伸出的第一输出端和第二输出端，在第一输出端上设置有第一偏心轮，在第二输出端上设置有第二偏心轮，第一偏心轮和第二偏心轮形状相同且两者之间转动的相位相差等于180°/吸入腔数量。本实用新型泵本身结构所承载的负载只有单个泵头的1.5倍左右，出水的频率会变快、出水的连续更好，单次出水的出水量的峰值也会变小，不但可以减小电机的电流、温升这些参数，还可以使泵出水变得更平衡、顺畅，有助于改善管路的振动和噪音。