本实用新型公开了一种含汞废水深度处理系统，包括沉淀池，与所述沉淀池的出水口相连的多介质过滤器，与所述多介质过滤器的净水出水阀相连的超滤装置，本实用新型的有益效果在于：通过在沉淀池中将含汞废水进行化学处理，经第一提升泵提升至多介质过滤、超滤装置去除水中的悬浮物、胶体等杂质后，在第一加注口通过次氯酸钠或酸液调节净水的PH值，使其呈弱酸性后进入超滤装置，再经第二提升泵提升至除汞单元，提升过程中在第二加注口加入还原剂，还原水中残留的余氯，经填充有除汞树脂的汞吸附柱脱除废水中的汞后，进入储水箱，储水箱的水可以达标排放或提升至别处他用，形成一个有效完整的除汞系统。