为解决水库闸门结构中止水带使用寿命低的问题，本实用新型提出一种闸门止水结构，包括相互匹配的闸门和门槽；闸门出水侧的边缘设置有止水带；同时闸门出水侧还设置有导轮，且导轮的回转半径大于止水带的厚度；所述门槽内设置有导轮槽，且导轮与导轮槽相对应。本申请在实际应用中，通过将止水带设置在闸门的侧面，利用水的压力让闸门与门槽贴合，防止漏水，同时在闸门侧面设置导轮，有效的在闸门上下过程中对止水带进行保护；解决了水库闸门结构中止水带使用寿命低的问题，同时止水带设置在闸门侧面，其维修方便，降低了闸门结构的维修成本。