本实用新型属于分层采集水质监测技术领域，具体涉及一种水质监测自动取样装置，包括取样架和设置在取样架底部的控制台，所述取样架由上至下设有多个取样器，所述取样器包括取样管、输送泵、出样管和若干个储样管，所述取样管通过输送泵与出样管连接，所述出样管的出口对准其中一个储样管，若干个所述储样管均匀分布在环形冷藏通道内，所述环形冷藏通道能够在驱动机构的作用下带动储样管转动，当环形冷藏通道转动一定角度后，出样管的出口对准另一个储样管，所述控制台分别与输送泵、驱动机构、环形冷藏通道电性连接。本实用新型具有自动化程度高、采样效率高、样本保存度好等优点，操作方便，适用范围广。