一种用于植物育苗的水质净化系统，包括进水管路、石英砂过滤器、树脂过滤器、活性炭过滤器、中间水箱、加压泵、保安过滤器、紫外线消毒器、超滤器、纳滤器、废水管路、水质监测设备、回水管路、成品水箱、供水泵、育苗给水管路。水质监测设备设置不合格水质出水端连接所述回水管路，回水管路连接所述石英砂过滤器。本实用新型通过多层过滤以及多种水处理形式使得育苗用水品质有了显著的提升，从而保证了植物特别是名贵珍稀植物育苗的成活率。