本实用新型提供了一种进样小瓶清洗装置，属于容器清洗设备技术领域，包括机架、托盘机构和内刷机构，托盘机构设在机架上，且设有若干用于容纳进样小瓶的容置槽，容置槽内设有用于与进样小瓶外壁抵接的刷毛组件；内刷机构设在机架上，且具有靠近和远离托盘机构的移动自由度，包括若干分别与容置槽对应、且用于置入进样小瓶内的毛刷和用于驱动毛刷转动的第一驱动组件。本实用新型通过托盘机构和内刷机构的配合，利用刷毛组件和毛刷同时对进样小瓶进行全方位清洗，结构简单，操作方便，能够替代人工，在段时间内实现大量进样小瓶的清洗，能够提高清洗效率和清洗效果，进而有利于提高检测效率。