本实用新型提供一种细胞组织石蜡包埋装置，包括：模芯底座和模具外壳，所述模具外壳设置在所述模芯底座上，所述模芯底座包括底板和设置于所述底板上的模芯，所述模具外壳上设置有包埋孔，所述包埋孔为通孔，所述模芯与所述包埋孔相适配，所述模芯上设置有限位滑槽，所述模具外壳上设置有定位螺孔，定位装置通过所述定位螺孔滑动设置于所述限位滑槽内，将所述模具外壳相对于所述模芯定位。本实用新型提供的细胞组织石蜡包埋装置在对细胞组织进行石蜡包埋时，操作简便，蜡块易于脱模、不产生粘附、蜡块表面光滑平整，包埋后的蜡块无需修整。该细胞组织石蜡包埋装置结构简单、紧凑，易于加工、制造成本低，可重复进行使用，经济环保。