本实用新型涉及河湖清淤技术领域，具体涉及一种河湖污染底泥生态清淤船。包括船体、输送管、锥形斗、抽吸泵、旋转驱动装置、连接装置和匚型转动架，船体两侧固定有矩形框架，矩形框架上滑动设有滑动台，滑动台上固定有卷扬机，植被保护装置通过钢索吊装在卷扬机上，植被保护装置上固定有机械臂，输送管上端与滑动台固定连接，下端与机械臂活动端固定连接，旋转驱动装置的驱动端与连接装置固定连接，连接装置上安装有用于抓紧或放开匚型转动架的卡爪，匚型转动架两端设有向下延伸用于绕卷植物的绕柱。本船体旋转带动匚型转动架旋转，使带状植物蜷曲，使植物本体覆盖的面积最小化，从而达到保护植物的目的。同时清淤时可实现精确定位，避开河底植被。