本实用新型提供一种棉芯分离装置，包括沿左右方向设置的输送带，所述输送带的左端部为入料端，所述输送带的右端部为出料端，所述输送带的出料端上方设有旋转切刀，所述旋转切刀上连接用于驱动其旋转的第一驱动电机，所述第一驱动电机的输出轴连接所述旋转切刀的中部，所述第一驱动电机的输出轴沿前后方向设置，所述第一驱动电机的输出轴的延伸方向垂直于所述旋转切刀所在的平面。采用本实用新型提供的棉芯分离装置，输送带将棉芯从输送带的入料端输送至输送带的出料端，第一驱动电机驱动旋转切刀快速旋转，旋转切刀利用周边的刀口对输送过来的棉芯的侧面进行轴向切割，骨架和棉线可以分开回收，降低回收成本。