本实用新型的目的是提出一种锁车自动升窗器主机结构，提供了充裕的空间设置锁车自动升窗控制模块电路，避免锁车自动升窗控制模块电路与按键开关检测电路发生干涉。该锁车自动升窗器主机结构包括主机壳体，所述主机壳体上设有左前窗开关、右前窗开关、左后窗开关、右后窗开关、车窗锁定开关和插头，所述主机壳体内设有上层电路板和下层电路板，所述上层电路板设有按键开关检测电路及ECU电路，所述下层电路板设有锁车自动升窗控制模块，所述上层电路板和下层电路板电连接，所述按键开关检测电路通过若干触点与所述左前窗开关、右前窗开关、左后窗开关、右后窗开关、车窗锁定开关驱动连接，所述触点设置在所述上层电路板的上表面。