一种多肽合成反应装置，本实用新型涉及多肽合成技术领域；限位板固定在工作台上表面的右端上，限位板的左侧壁上等距固定有数个弹簧，弹簧的左端固定在活动板上，活动板的左侧设有支撑板，支撑板的后侧壁上固定有电机，该电机输出轴穿过支撑板后，插设在凸轮内，活动板的上表面上固定有反应座，反应座的内部插设有数个限位管，限位管内嵌设有反应柱，该反应柱的上端露设在限位管的上方，反应柱插设在限位管内，限位管两两相接触固定连接后插设在反应座内，通过凸轮的转动带动活动板左右移动，活动板带动反应座左右移动，从而可同时对数个反应柱内的多肽进行摇晃搅拌反应，进而省时省力，本实用新型具有设置合理，制作成本低等优点。