本实用新型涉及分层取样技术领域，尤其涉及一种手持式红树林沉积物分层取样装置，解决了现有技术中存在的在对红树林的整体生态系统进行研究时，需要进行取样工作，但由于红树林沉积物的层数较深，其分层取样工作很不便的缺点，包括立柱杆，其顶部设置有顶板，且立柱杆的底部固定连接有平衡板，立柱杆的外侧壁上开设有导向槽，取样筒的末端设置有钻头，取样筒的内部设置有活塞，活塞的末端连接有取样头，该活塞的顶端设置有操作柄。本实用新型通过锁定栓可固定住平衡板，而后利用平衡板平衡设备与作业地面，而后沿导向槽下压，利用钻头实现层级的钻入，并进一步的利用取样头进行取样工作，分层取样工作方便简单可靠。