本实用涉及选育技术领域，且公开了一种用于发酵无抗饲料菌株的选育装置，包括选育箱体，所述选育箱体内部的前方从左到右依次固定安装有第二连接密封箱、附菌箱、发酵箱与第一连接密封箱，所述附菌箱与发酵箱的背面分别固定安装有烘干箱与清洗箱，所述第二连接密封箱右侧的前方与附菌箱连通，所述第二连接密封箱右侧的后方与烘干箱连通，所述第一连接密封箱左侧的前方与发酵箱连通。该实用新型，整个装置能配合着第一进流管、第二进流管、第一换流管、导出管、进气管与第二换流管共同形成了一个自动化的选育步骤，大大的减少了人力，并且四个固定板同时运作，提高了装置的效率，从而提高了装置的实用性。