本实用新型提供一种分区域的标本运输箱，涉及标本运输领域，包括箱体，所述箱体包括外壳，所述外壳顶端与内衬顶端固定连接，所述内衬中心设有与其固定连接的固定管，所述固定管、内衬底部、侧壁分别设有扇形槽，位于所述外壳与内衬之间的通槽处设有隔离架，所述隔离架与内衬滑动连接，所述隔离架位于固定管部分的内侧固定连接有支撑环，所述支撑环内侧插接有固定轴，所述固定轴与固定管顶部卡接，所述外壳顶部连接有密封盖。本实用新型中，能够使不同的标本独立保存运输，避免相互污染，能够根据不同种类标本的数量调整容腔大小，适用性更强，调节方便。