本实用新型公开了一种医药中间体的纯化装置，具体涉及医药设备领域，包括底座、纯化箱和收集箱，所述收集箱固定设于底座和纯化箱之间，且纯化箱位于收集箱上方，所述纯化箱中部开设有空腔，所述空腔顶端两侧均开设有清洗通道，所述空腔底端两侧均开设有加热通道，所述空腔内部贯穿有固定块，所述固定块中心处固定设有连接轴，所述固定块顶端和底端设有活动块，所述固定块与活动块之间固定连接弹簧件，所述纯化箱内部设有加工腔，所述清洗通道与加工腔之间固定设有连接孔，两组所述加热通道之间固定设有连接通道，且连接通道位于加工腔底部。本实用新型便于对纯化箱进行维修检查、加热使用、振动落料及清洗，从而提高使用效果。