本实用新型公开了一种医疗废物高温焚烧异味处理系统，包括焚烧炉，所述焚烧炉的顶部一侧设有净化箱，所述净化箱与所述焚烧炉之间通过出烟管相连通，所述净化箱的中间设有隔板，所述隔板的一侧设有喷淋装置，所述隔板的另一侧设有支撑板，所述支撑板的下方设有过滤装置，所述过滤装置包括第一过滤网，所述第一过滤网的上方设有碱石灰层，所述碱石灰层远离所述第一过滤网的一侧设有活性炭吸附层，所述活性炭吸附层的一侧位于所述隔板上设有连通管，所述喷淋装置包括第一水箱，所述第一水箱的一侧与水泵连接。有益效果：增加了烟气的循环过滤，增加了排出烟气的纯净度，同时能够对烟气过滤冷却，避免对周围的植被造成影响，大大增加了安全性。