本实用新型涉及一种水肥一体灌溉系统，包括抽水泵、第一过滤器、肥料输送机构、第二过滤器、水肥喷灌机构和PLC控制器，抽水泵的一端与第一过滤器的一端连接，第一过滤器与肥料输送机构并联设置，第一过滤器的另一端和肥料输送机构通过混合管与第二过滤器的进水管连接，第二过滤器的出水管与水肥喷灌机构连接；第四电磁阀设于第二过滤器与水肥喷灌机构之间，旁路管路的一端与混合管连接，旁路管道的另一端与出水管和第四电磁阀之间的管路连接，第三电磁阀设于旁路管路上，第一电磁阀设于旁路管路的一端与进水管之间的混合管上，第二电磁阀设于第二过滤器的排污管上。本实用新型结构简单、能够实现对过滤器的自动反冲洗、提高过滤效率。