本实用新型涉及一种用于添加微藻藻种的自动加料装置，所述自动加料装置包括藻液箱、泵、加料装置、至少一个扩种容器、驱动电机、传送装置和控制装置，所述藻液箱通过输出管道连接加料装置，所述泵接入输出管道，所述扩种容器放置在传送装置上，所述驱动电机连接传送装置并驱动传送装置运动，所述加料装置包括加料控制阀、第一机械手和第二机械手，所述加料控制阀安装在输出管道的末端，所述第一机械手和第二机械手分别设置在传送装置的两侧，第二机械手用于抓取和盖上扩种容器的盖子，第一机械手用于将藻液加入到扩种容器中；所述藻液箱、泵、加料装置和驱动电机通过线路连接所述控制装置。