本实用新型涉及一种用于河道治理的交汇口截污系统，包括通水管道，位于通水管道的出水端的外面设置有与通水管道间隔设置的长条状的垃圾收集池，垃圾收集池的长度方向自通水管道的出水口的左侧向右侧设置，通水管道和垃圾收集池之间设置有向垃圾收集池方向倾斜设置的两个侧板，侧板位于高处的一端伸至垃圾收集池的池口的正上方，侧板位于低处的一端与通水管道内孔的底端齐平，位于两个侧板之间设置有用于阻拦垃圾并将垃圾送至垃圾收集池的池口处的不锈钢网链，不锈钢网链呈环形，相对的侧板之间设置有带动不锈钢网链顺时针方向转动的驱动机构。本实用新型具有将交汇口处的垃圾从河道中清理出去，从而避免出现垃圾堆积造成交汇口堵塞的情况。