本实用新型提供了一种用于医疗废水治理的取样装置，包括取样筒，在取样筒内沿取样筒中轴线方向且通过轴承与轴座配合活动连接有转动轴，在取样筒上端近端部其中相对的两侧设有进液口，在转动轴的上端近端部设有与取样筒内腔相适应的第一活动塞，在第一活动塞上设有与各进液口相适应的第一连通口；在取样筒的下端近端部其中相对的两侧设有收集口，在转动轴的下端近端部设有与取样筒内腔相适应的第二活动塞，在第二活动塞上设有与各收集口相适应的第二连通口；在取样筒内底部设有与转动轴联动连接的驱动组件，在取样筒的内顶部设有与转动轴连接的定位组件；本实用新型结构紧凑、操作简单，可方便采集医疗废水，具有较强的实用性。