本实用新型提供一种生物干化仓分区加热系统，包括进水总管、出水总管以及多根加热管道。所有的加热管道按照分区排布方式铺设于生物干化仓的仓底，以在生物干化仓的仓底形成多个加热分区进行分区加热，每一加热分区内铺设有至少一根加热管道，每一加热分区具有连通于进水总管的进水端和连通于出水总管的出水端，进水总管中的热水从进水端分别进入各个加热分区的加热管道并通过出水端流出汇集到出水总管。每个加热分区独立加热，不会互相干涉，生物干化过程的温度更加可控和精确，且能够避免由于个别加热分区出现故障而影响整个生物干化仓的运行。每个加热分区进出水温差小，水流流经的路径较短，维持进出水温差的能耗相对更低。