本实用新型涉及污水处理技术领域，且公开了一种用于小微水体生态修复的生物酶处理装置。该用于小微水体生态修复的生物酶处理装置，包括装置本体，装置本体的内部开设有微生物储料室，微生物储料室的下方设置有处理室。该用于小微水体生态修复的生物酶处理装置，将微生物投放至微生物储料室内进行储存，并通过投料盒定期投入营养液进行培养，微生物流入输送管道内，此时通过驱动电机带动截流块将输送管道内部被堵塞的部位形成通路，使微生物流入处理板，利用微生物储料室内部储存的微生物，可根据处理水质的特性通过控制限流装置快速提高微生物的浓度进而提高处理效果，同时也可预防因生物酶失活后导致处理装置失去净化能力的问题。