本实用新型公开了一种畜禽水线杀菌清洗机，底盘上设有水路模块，底盘上还设有臭氧模块、压缩空气模块和脉冲发生模块，臭氧模块连接至水路模块，压缩空气模块的出气端连接至水路模块，脉冲发生模块位于压缩空气模块和水路模块之间，并使得压缩空气模块和水路模块之间脉冲通断；本实用新型通过臭氧模块将臭氧按照一定比例均匀的混合到水路模块中形成臭氧水通过管路注入到饮水水线中，通过脉冲发生模块将压缩空气模块产生的压缩空气注入到臭氧水管路中产生脉动，利用压缩空气在水中产生气泡，气泡爆炸产生能量将饮水管路内壁的生物膜击碎，让生物膜脱落，然后利用臭氧水在杀菌消毒的同时将生物膜带出水线，具有杀菌、消毒效果好。