本实用新型适用于禽类养殖技术领域，提供了一种孵化室消毒装置，包括进药装置、送药装置和药管，其中，所述药管为软管，且所述药管一端连接所述进药装置、另一端还连接有棉条，所述送药装置设置在所述进药装置和所述棉条之间；所述进药装置包括有药桶，所述药桶底部设置出药口，所述出药口连接所述药管；所述送药装置包括挤压座、转轴和辊轴，所述转轴带动多个所述辊轴围绕转轴旋转，所述辊轴到所述挤压座的最小距离小于所述药管的外径、且能保证转轴正常旋转。能够实现自动进药与消毒，还能控制消毒药剂的消耗量，提高消毒药剂的利用率。