本实用新型公开了一种医疗垃圾处理设备，包括机壳、分离板、搅拌机构和驱动电机，所述分离板上设置有通孔，所述分离板的底部中央固定连接有连接轴，所述分离板的上部中央设置有搅拌机构，本实用新型通过设置的分离板、搅拌机构以及驱动电机，实现了在医疗垃圾焚烧前，通过搅拌机构以及分离板上的摩擦球对医疗垃圾进行充分搅拌振动，使得医疗垃圾内部的残留药液流出，进入分离板下方进行分离，防止后续高温焚烧时产生爆鸣乃至爆炸的问题，同时实现了在医疗垃圾焚烧前，将医疗垃圾进行烘干，为后续医疗垃圾的高温焚烧预热以减少高温焚烧炉的热量损失。