本实用新型公开了一种药师专用药品分拣机构，包括工作台、分拣槽、电机、水溶药粒包储存柜和隔离板，所述工作台的左端上表面固定设置有入料口，且工作台的上表面开设有分拣槽，所述工作台的前端外表面固定设置有电机，且电机的输出端安装有滚筒，并且滚筒贯穿工作台的前端外表面，所述滚筒的后端表面固定设置有第一矩形齿轮，且第一矩形齿轮的外表面连接有齿轮链。该药师专用药品分拣机构，当药品从入料口倒入到分拣槽后会被滚动的圆柱块进行运输，而由于等间距开设的圆柱块之间的距离逐渐增大，从而大小不同的药品则会分别被分拣落入到水溶药粒包储存柜、小瓶药罐储存柜和大瓶药罐储存柜中，达到人工分拣的效果。