本实用新型公开了一种用于集装箱发电机组的防水排烟结构，包括有排烟口盖板和排烟直管，在排烟口盖板中设有排烟口，排烟直管从排烟口中穿过伸出在排烟口盖板的上下两侧；在排烟口的边缘设有翻边结构，在排烟直管的外壁上设有防水边，在排烟直管穿入排烟口盖板后，防水边压在翻边结构上，并且将防水边与翻边结构之间及翻边结构与排烟口盖板表面之间均设置为密封结构。本实用新型通过在集装箱顶部设置排烟口盖板，在排烟口盖板上用于穿入排烟管的排烟口周围设置朝上凸起的翻边结构，同时在排烟管的管壁上设置防水边，固定好排烟管后，防水边与翻边结构贴合并焊接密封，这样可以起到很好的防水隔烟效果，能有效防止雨水溢入和烟气溢出。