本实用新型提供了一种同步升降控制系统及具有其的自动升降脚手架，该同步升降控制系统包括主控单元、储水箱、监测探头以及报警设备，储水箱和监测探头均为多对，每对的两个储水箱设置在脚手架相邻的两个监测点位上，每对的两个储水箱的底部通过连通管相互连通；每对监测探头对应设置在对应的一对储水箱内，每对监测探头用于在脚手架上升或下降过程中相邻的两个监测点位出现高度差时向主控单元发送感应信号，主控单元根据感应信号控制报警设备报警以及控制各个提升机构停止运行。从而在脚手架上升和下降过程中，脚手架各个点位上升或下降速度不一致时，对脚手架进行保护，避免脚手架倾斜或者变形而影响脚手架的结构安全。