本实用新型公开了一种具有通过呼出的甲烷和氢气进行胃肠疾病检测系统，包括氢气检测仪本体和气体收集袋，包括氢气检测仪本体内部的一侧开设有进气腔，进气腔内壁的一侧开设有进气口，进气口连通设有第一连接管，第一连接管的一端与第二连接管的一端穿插连接，本实用新型一种具有通过呼出甲烷和氢气进行胃肠疾病检测系统，压缩板通过推杆的推动，压缩板的一侧可以均匀的对气体收集袋的一端进行受力，使得气体可以均匀的进入进气腔的内部，使得气体传感器检测的误差减小，更加精准的检测疾病；通过在第一连接管和第二连接管之间设有的密封固定机构，可以增加对两个连接管的固定以及密封，避免气体的反作用力将气体收集袋弹出。