一种三色光纤记录系统包括LED发光光源、若干滤光片、若干二向色镜、若干探测器、采集卡、单模光纤、光纤探针和耦合透镜；所述LED发光光源的输出端后依次设有滤光片、二向色镜、耦合透镜、单模光纤和光纤探针；所述耦合透镜后依次设有二向色镜、滤光片、探测器和采集卡；所述采集卡连接到计算机；所述二向色镜均横向倾斜45度角放置；所述LED发光光源包括激发光源A1、激发光光源A2、对照光源A3，所述激发光源A1采用中心波长为560nm的黄绿光光源，所述激发光源A2采用中心波长为470nm的蓝光光源，所述对照光源A3采用中心波长为410nm的紫光光源。本实用新型增加了对照光路，在实现两种光同时进行实验的同时还能够去除实验过程产生的噪声，使得实验数据更准确。