本实用新型涉及发酵设备领域，且公开了一种用于微生物高效发酵的发酵装置，包括发酵罐体和驱动电机，驱动电机的输出轴通过联轴器固定连接有连杆，连杆的下端固定连接有空心的圆柱体，圆柱体的内顶壁固定连接转动电机，转动电机的输出轴固定连接有转杆，连杆的轴体上下阵列设置有多组搅拌组件，搅拌组件包括上下等间距固定在连杆上的第一锥齿轮，第一锥齿轮的左右两侧均啮合有左右对称设置的第二锥齿轮，第二锥齿轮的轴心上固定连接有第一搅拌杆，圆柱体的外段本体均一体成型有多个间距分布的第二搅拌杆，本实用新型通过纵横两个方向的搅拌方式减少了搅拌中常出现的原料规律移动的情况出现，提高了微生物发酵的效率。