本实用新型公开了一种细胞程序降温盒，包括：盒体和盒盖，在盒体中安装冻存管管架，冻存管管架包括样本槽和样本架，样本槽与样本架之间可拆卸连接，样本槽与盒体之间的空间用于装异丙醇，样本架安装在于样本槽结构上方，样本架上设置有若干插孔，且插孔与样本槽上的凹槽一一对应，冻存管插设在样本架的插孔内，装有冻存管的样本架置于盒体内，且使得冻存管下端插进样本槽的凹槽内。本实用新型样本架放置在样本槽上，样本槽可水平放置，此时冻存管再装到样本架上，最后再一起放入细胞程序降温盒的盒体内，在放置和转移样本架的过程中，冻存管一直保护于样本槽内，从而实现多个冻存管的一起装入和取出，安全稳定，操作方便。